黑龙江建筑职业技术学院机电系是下属院系，设有建筑电气工程技术（含电气设备安装及自动化、建筑消防及电气设计方向）、楼宇智能化工程技术等专业。其中建筑电气工程技术专业创建于1971年，2004年被高职高专教学指导委员会确定为重点专业，2006年11月获批成为地方财政支持重点建设专业。
该系实行工学结合校企合作“2+1”人才培养模式，推行“双证书”教学制度。2024年开展机电系现场工程师一期项目建设（预算49.6万元，最终由哈尔滨蝉夏商贸有限公司以494,480.00元中标） 、高本贯通模拟10KV光伏变电站实训平台建设（中标金额167.9万元） 及金课建设（预算60万元） 。2025年，机电系发布了机器人综合实训基地招标公告（预算金额464万元） ，并发布了建筑智能化工程技术专业教学资源库平台升级项目竞争性磋商公告 。
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