合肥市第九中学新站校区选址新站区淮海大道和大众路交口东南角，占地面积约216亩，总投资8.26亿元，将建设教学楼、活动场馆、体育馆和学生宿舍等，规模达到120个班级，计划于2018年开工，2020年秋季正式开学。
学校2024年秋季实现一校两区集团化办学，新站校区为全封闭寄宿制学校，校区布局科学，配备超前，是一所集现代化、智慧化、生态化和人文化为一体的美丽校园。四牌楼校区是合肥教育寻根地，2024年9月以“半走读封闭式”管理模式回归，校区拥有全新理化生实验室、学生活动室、图书馆、多媒体学术报告厅等，着力构筑一流育人环境，努力打造精品教育。
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