国家深海基地南方中心（Southern Base of the National Deep Sea Center，缩写：Southern Base of the NDSC）是中国第二个、世界第六个国家级深海技术支撑基地，由中国科学院深海科学与工程研究所主导建设，定位为深海科学研究、装备研发制造、成果转化应用及对外交流合作的综合性平台。该中心依据中央12号文件提出，位于海南三亚崖州湾科技城。
中央12号文件明确提出要建设国家深海基地南方中心。2016年，中国科学院深海科学与工程研究所在三亚建成，随后组织了“深海勇士”号4500米载人潜水器的海试。 该中心依托深海科技城建设，拥有“深海勇士”号载人潜水器等装备，推进南山港公共科考码头、南海地质科技创新基地等项目建设。其以深海空间站、全海深载人潜水器等国家重大项目为抓手，引进国际深远海科研资源，构建产学研模式。
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