末端氧化酶（terminaloxidase）是呼吸链末端催化电子传递给氧气生成水或过氧化氢的酶类，包含线粒体内膜的细胞色素氧化酶、交替氧化酶（AOX），以及细胞质中的酚氧化酶、抗坏血酸氧化酶、乙醇酸氧化酶等类型。NADPH-细胞色素C(P-450)被归类为该酶成员，其还原态可与一氧化碳结合并在450nm处有特征吸收峰 。植物中该类酶参与环境适应，其组成随发育阶段或感病状态变化 。
结核分枝杆菌的细胞色素bcc复合物作为末端氧化酶可结合抗结核候选药物Q203/TB47，通过阻断醌底物结合位点抑制ATP合成。其补偿通路细胞色素bd复合物具有双氧气运输通道及物种特异性Q-loop结构，解析耻垢分枝杆菌的该结构为抑制剂开发提供依据 。植物叶绿体末端氧化酶PTOX在逆境中维持光合电子传递链功能并防止活性氧积累，AOX基因在非生物胁迫下呈现差异表达 。
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