国家防总工作组是国家防汛抗旱总指挥部根据《国家防总工作组管理工作暂行办法》派出的临时组织，通常在启动Ⅲ级及以上应急响应或发生较大险情时组建，主要职责是赴地方执行督促、检查、指导和协助防汛抗旱工作的任务 。
例如，2010年青海玉树地震后，工作组即赶赴现场评估水利工程险情 。2021年河南新乡发生洪涝灾害时，工作组协调调拨冲锋舟等物资并指导抢险救援 。2024年四川汉源发生暴雨泥石流灾害后，工作组亦紧急赶赴现场 。2026年，为应对重庆等地的汛情，国家防总派出工作组指导城市内涝处置等工作 。
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