《药师如来本愿经》，亦称《药师如来本愿功德经》，简称《药师本愿经》《药师经》，是佛教经典。隋代天竺三藏达摩笈多于大业十二年（616年）在洛阳译出，一卷 。本经为历代大藏经所收，敦煌遗书亦有收藏 。
该经共有五个汉译本 。隋代以前，其早期译本曾被疑为伪经，隋代由于梵本传入，译本得到重译与认可，药师佛信仰由此开始流行 。唐代玄奘翻译的《药师琉璃光如来本愿功德经》吸收各版内容，成为后世最流通的译本 。经文主要叙述药师如来在行菩萨道时所发十二大愿，及其东方净琉璃世界的功德庄严 。
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